CO1 Amplicon Sequence Variants of soil and leaf litter arthropod communities collected at Malaise traps from the Insect Biome Atlas project in Sweden

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、77,646 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

バージョン	公開されました。	レコード	変更の要約	DOIハンドル	最終更新者
1.4	2025-02-11 18:19:40	77,646	Added occurrence data.		Maria Prager
1.3	2024-11-13 10:25:10	0	Attempt to reverse some weird automatic conversion of Title, Short Name and Description fields (to values from lysate dataset)		Maria Prager
1.2	2024-11-13 09:56:33	0	Data description was corrected, bibliographic DOI duplicate removed		Maria Prager

全5 の _start _から3までを表示する。

前にもどる12次にすすむ

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Miraldo A, Sundh J, Iwaszkiewicz-Eggebrecht E, Granqvist E, Manoharan L, Łukasik P, Tack A J M, Andersson A F, Roslin T, Ronquist F (2025). CO1 Amplicon Sequence Variants of soil and leaf litter arthropod communities collected at Malaise traps from the Insect Biome Atlas project in Sweden. Version 1.4. Swedish Museum of Natural History. Occurrence dataset. https://www.gbif.se/ipt/resource?r=iba_co1_soil_litter_2019_se&v=1.4

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Swedish Museum of Natural History。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 6fbb851d-7a13-4242-bea7-3b931a0cfc47が割り当てられています。   GBIF Sweden によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているSwedish Museum of Natural History が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Metadata; Observation

連絡先

地理的範囲

Sweden

生物分類学的範囲

Insects

時間的範囲

プロジェクトデータ

The Insect Biome Atlas (IBA) is a large-scale insect project aimed at charting the insect faunas of Sweden and Madagascar and their associated microbiomes using high-throughput DNA sequencing of Malaise trap and soil samples. The main aim is to describe the insect faunas of these two biologically and geologically very different countries in unprecedented detail. The Swedish insect fauna consists of postglacial immigrants and is one of the best studied in the world. Madagascar is the world’s most important biodiversity hotspot, with a long period of evolution in isolation and where many species are critically endangered if not already extinct. During the field phase in 2019-2020, weekly samples were collected in both countries for a 12-month period. Insects were collected using Malaise traps: 203 traps in Sweden and 50 in Madagascar. Several other types of samples and ecological measurements were also collected at all trap sites to gather a full understanding of the ecological roles of the organisms that comprise the insect biomes and associated microbiomes. In total, IBA collected ca 8,000 insect community samples. The identification of all insects in the material and the organisms they interact with, such as pathogens as well as symbiotic fungi and bacteria, was achieved using metabarcoding and high-throughput DNA sequencing. In Sweden the Malaise traps were managed by over 150 volunteers, which makes this project one of the largest citizen science projects to take place in Scandinavia. The Swedish inventory was implemented in collaboration with Station Linné and the Malagasy inventory in collaboration with Madagascar Biodiversity Centre, both very active entomological research stations.

プロジェクトに携わる要員:

収集方法

Soil and leaf litter arthropod communities were sampled during the growing season (26th of June 2019 to 27th of July 2019) at each Malaise trap location of the Insect Biome Atlas project in Sweden. Leaf litter arthropod communities were sampled by collecting a total volume of 1 L of leaf litter from five different sites around each Malaise trap, 2.5 meters away from the nearest extremity of the trap. Soil arthropod communities were sampled using soil cores (5.5 cm diameter) with a depth of 10 cm at exactly the same five sites where litter samples were taken. The five soil core samples from each Malaise trap location were pooled and mixed by hand immediately after collection. See 'Soil and litter samples' in https://doi.org/10.1101/2024.10.24.619818.

Method step description:

1. See 'Soil and litter samples' in https://doi.org/10.1101/2024.10.24.619818.

書誌情報の引用

1. Miraldo, A., Sundh, J., Iwaszkiewicz-Eggebrecht, E., Buczek, M., Goodsell, R., Johansson, H., Fisher, B. L., Raharinjanahary, D., Rajoelison, E. T., Ranaivo, C., Randrianandrasana, C., Rafanomezantsoa, J.-J., Manoharan, L., Granqvist, E., van Dijk, L. J. A., Alberg, L., Åhlén, D., Aspebo, M., Åström, S., Bellviken, A., Bergman, P.-E., Björklund, S., Björkman, M. P., Deng, J., Desborough, L., Dolff, E., Eliasson, A., Elmquist, H., Emanuelsson, H., Erixon, R., Fahlen, L., Frogner, C., Fürst, P., Grabs, A., Grudd, H., Guasconi, D., Gunnarsson, M., Häggqvist, S., Hed, A., Hörnström, E., Johansson, H., Jönsson, A., Kanerot, S., Karlsson, A., Karlsson, D., Klinth, M., Kraft, T., Lahti, R., Larsson, M., Lernefalk, H., Lestander, Y., Lindholm, L.-T., Lindholm, M., Ljung, U., Ljung, K., Lundberg, J., Lundin, E., Malmenius, M., Marquina, D., Martinelli, J., Mertz, L., Nilsson, J., Patchett, A., Persson, N., Persson, J., Prus-Frankowska, M., Regazzoni, E., Rosander, K.-G., Rydgård, M., Sandblom, C., Skord, J., Stålhandske, T., Svensson, F., Szpryngiel, S., Tajani, K., Tyboni, M., Ugarph, C., Vestermark, L., Vilhelmsson, J., Wahlgren, N., Wass, A., Wetterstrand, P., Łukasik, P., Tack, A. J. M., Andersson, A. F., Roslin, T., & Ronquist, F. (2024). Data of the Insect Biome Atlas: A metabarcoding survey of the terrestrial arthropods of Sweden and Madagascar. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2024.10.24.619818

追加のメタデータ